Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRKQ15262 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
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