Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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