Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN1Q14699 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN1Q14699 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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