Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBFBQ13951 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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