Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TUBA3CQ13748 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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