Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DNASE1L3Q13609 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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DNASE1L3Q13609 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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DNASE1L3Q13609 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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DNASE1L3Q13609 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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DNASE1L3Q13609 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DNASE1L3Q13609 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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