Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE3BQ13370 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms