Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRSF6Q13247 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRSF6Q13247 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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