Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SRSF5Q13243 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms