Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIK3Q13003 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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