Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PTP4A2Q12974 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PTP4A2Q12974 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PTP4A2Q12974 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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PTP4A2Q12974 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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PTP4A2Q12974 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTP4A2Q12974 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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