Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGEF5Q12774 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGEF5Q12774 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms