Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms