Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PSME1Q06323 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME1Q06323 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms