Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CHRNEQ04844 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms