Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms