Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK6Q00534 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK6Q00534 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms