Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PITPNAQ00169 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PITPNAQ00169 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms