Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM3AP98173 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms