Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCL7P80098 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL7P80098 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL7P80098 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL7P80098 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL7P80098 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL7P80098 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL7P80098 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL7P80098 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms