Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTA2P62736 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms