Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VBP1P61758 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VBP1P61758 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VBP1P61758 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms