Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ACTBP60709 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ACTBP60709 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ACTBP60709 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACTBP60709 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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