Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX16P57768 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNX16P57768 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX16P57768 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNX16P57768 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX16P57768 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNX16P57768 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms