Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
POLR2IP36954 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
POLR2IP36954 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms