Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
THBS4P35443 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THBS4P35443 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THBS4P35443 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THBS4P35443 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
THBS4P35443 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
THBS4P35443 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
THBS4P35443 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
THBS4P35443 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms