Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA13P31271 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms