Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLD1P28340 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLD1P28340 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLD1P28340 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLD1P28340 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms