Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRGP23470 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
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