Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGCP20142 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGCP20142 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGCP20142 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms