Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM21P19474 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms