Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BPIP17213 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPIP17213 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPIP17213 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms