Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms