Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNRPBP14678 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNRPBP14678 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNRPBP14678 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPBP14678 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPBP14678 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPBP14678 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNRPBP14678 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms