Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXD8P13378 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXD8P13378 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms