Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms