Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KRT3P12035 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRT3P12035 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT3P12035 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT3P12035 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT3P12035 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms