Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ITGAMP11215 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms