Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms