Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGB3P05106 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms