Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PAPLNO95428 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PAPLNO95428 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms