Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GATBO75879 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GATBO75879 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GATBO75879 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms