Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SYNGR2O43760 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms