Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMD9O00233 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMD9O00233 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms