Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GOLGA8SH3BPF8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms