Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms