Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF839A8K0R7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF839A8K0R7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms