Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GJE1A6NN92 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms