Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
A3GALT2U3KPV4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms