Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNX10Q9Y5X0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX10Q9Y5X0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms